建设工程合同纠纷的诉讼时效为3年，超过20年不予保护，特殊情况可延长；建设工程施工合同纠纷以施工行为地为合同履行地，其他建设工程纠纷适用不动产所在地原则专属管辖。
法律分析
一、建设工程合同纠纷的诉讼时效有多长
1、建设工程合同纠纷的诉讼时效有3年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害之日起计算，自权利受到损害之日超过二十年的人民不予保护，特殊情况可以申请适当延长。
2、法律依据：
《中华人民共和国民法典》第一百八十
向人民请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民不予保护，有特殊情况的，人民可以根据权利人的申请决定延长。
二、建设工程合同专属管辖规定
1、建设工程施工合同纠纷以施工行为地为合同履行地。”最高人民明确了建设工程施工合同纠纷的合同履行地为施工行为地，将建设工程施工合同纠纷排除在“不动产住所地人民专属管辖”之外。但，
2、分割、相邻关系等引起的物权纠纷。农村土地承包经营合同纠纷、房屋租赁合同纠纷、建设工程施工合同纠纷、性房屋买卖合同纠纷，按照不动产纠纷确定管辖。”最新的民事诉讼法解释明确了建设工程施工合同纠纷依据不动产所在地原则适用专属管辖。同样建设工程分包合同、内部承包合同、转包合同等纠纷，也应当不动产纠纷专属管辖。
结语
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十规定，建设工程合同纠纷的诉讼时效为3年，特殊情况可适当延长。此外，最高人民明确了建设工程施工合同纠纷的合同履行地为施工行为地，排除在不动产住所地人民专属管辖之外。因此，在处理建设工程合同纠纷时，请注意诉讼时效和专属管辖的规定。
法律依据
中华人民共和国公路法（2017修正）：第三章 公路建设 第二十三条 公路建设项目应当按照国家有关规定实行法人负责制度、招标投标制度和工程监理制度。
中华人民共和国民法典：第十八章 建设工程合同 第七百九十条 建设工程的招标投标活动，应当依照有关法律的规定公开、公平、公正进行。
中华人民共和国民法典：第十八章 建设工程合同 第七百八十 建设工程合同是承包人进行工程建设，发包人支付价款的合同。
建设工程合同包括工程勘察、设计、施工合同。
