法律分析：当员工面临公司克扣自己工资时，首先应该就此问题跟公司协商解决，避免走到最后诉讼仲裁的地步，若是协商不成则员工可以向当地劳动调解部门申请介入调解，需要注意的是此调解并不具备法律的强制性，因此若公司依然拒绝配合，则员工需要向相关劳动仲裁机构申请仲裁，在经过诉讼仲裁的程序之后还可以继续向人民起诉。
法律依据：《中华人民共和国劳动法》 第七十七条 劳动争议发生后，当事人可以向本单位劳动争议调解委员会申请调解解不成，当事人一方要求仲裁的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。当事人一方也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。对仲裁裁决不服的，可以向人民提起诉讼。
