工程合同违约纠纷的诉讼时效期限为3年，诉讼时效可以通过提出履行请求、被告同意履行、提起诉讼或申请仲裁等方式中断，诉讼流程包括起诉、答辩、调查、辩论和判决等步骤。及时处理违约行为可以减少损失。
法律分析
一、法律规定规定工程协议合同违约起诉期多久?
工程合同违约纠纷的诉讼时效是3年。
《中华人民共和国民法典》
第一百八十【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民不予保护，有特殊情况的，人民可以根据权利人的申请决定延长。
第一百九十二条【诉讼时效期间届满的法律效果】诉讼时效期间届满的，义务人可以提出不履行义务的抗辩。
诉讼时效期间届满后，义务人同意履行的，不得以诉讼时效期间届满为由抗辩;义务人已经自愿履行的，不得请求返还。
第一百九十三条【诉讼时效援引】人民不得主动适用诉讼时效的规定。
二、工程合同违约纠纷诉讼时效中断的情形有哪些?
《中华人民共和国民法典》
第一百九十五条【诉讼时效中断的情形】有下列情形之一的，诉讼时效中断，从中断、有关程序终结时起，诉讼时效期间重新计算：
(一)权利人向义务人提出履行请求;
(二)义务人同意履行义务;
(三)权利人提起诉讼或者申请仲裁;
(四)与提起诉讼或者申请仲裁具有同等效力的其他情形。
三、工程合同违约纠纷的诉讼流程是什么?
1、原告起诉。
2、受理后将起诉书副本送达被告。
3、被告在十五日内提交答辩状,在五日内将答辩状副本送达原告如果被告不提交答辩状,不影响审理。
4、决定开庭审理的案件,在三日前通知当事人并公告。
5、法庭调查阶段包括:当事人陈述;告知证人的权利义务，证人作证，宣读未到庭的证人证言;出示书证、物证和视听资料;宣读鉴定结论;宣读勘验笔录。
6、法庭辩论包括:原告及其诉讼代理人发言;被告及其诉讼代理人答辩;第三人及其诉讼代理人发言或者答辩;互相辩论。
法庭辩论终结，由审判长按照原告、被告、第三人的先后顺序征询各方最后意见。
7、法庭辩论终结，应当依法作出判决。判决前能够调解的，还可以进行调解，调解不成的，应当及时判决。
8、判决宣告。
事实上，绝大多数民事纠纷的诉讼时效都只有三年，而且，工程合同相对方有违约行为的，正常情况下守约方不会在三年内没有任何维权行为，发现对方有违约行为，守约方必须要及时处理，这样才能减少给本人造成的损失。
结语
工程合同违约纠纷的诉讼时效为三年，根据《中华人民共和国民法典》第18规定。诉讼时效期间从权利人知道或应当知道权利受损以及义务人之日起计算。诉讼时效届满后，义务人可以提出不履行义务的抗辩。诉讼时效可以中断，包括权利人提出履行请求、义务人同意履行义务、权利人提起诉讼或申请仲裁等情形。工程合同违约纠纷的诉讼流程包括原告起诉、被告提交答辩状、开庭审理、调查阶段、法庭辩论等环节。守约方应及时处理违约行为，以减少损失。
法律依据
中华人民共和国电子商务法：第三章 电子商务合同的订立与履行 第五十一条 合同标的为交付商品并采用快递物流方式交付的，收货人签收时间为交付时间。合同标的为提供服务的，生成的电子凭证或者实物凭证中载明的时间为交付时间；前述凭证没有载明时间或者载明时间与实际提供服务时间不一致的，实际提供服务的时间为交付时间。
合同标的为采用在线传输方式交付的，合同标的进入对方当事人指定的特定系统并且能够检索识别的时间为交付时间。
合同当事人对交付方式、交付时间另有约定的，从其约定。
中华人民共和国民法典：第九章 买卖合同 第六百三十四条 分期付款的买受人未支付到期价款的数额达到全部价款的五分之一，经催告后在合理期限内仍未支付到期价款的，出卖人可以请求买受人支付全部价款或者解除合同。
出卖人解除合同的，可以向买受人请求支付该标的物的使用费。
中华人民共和国民法典：第九章 买卖合同 第六百一十七条 出卖人交付的标的物不符合质量要求的，买受人可以依据本法第五百八十二条至第五百八十四条的规定请求承担违约责任。
