合作医疗跟社保不可以同时交。
社保和农村合作医疗是不可以同时缴纳和使用的，因为国家规定所有人是不能重复参加两种医保，社保一般是针对城镇户口的居民而言的，包括了五种基本保险：养老、医疗、失业、工伤、生育，以及住房公积金；农村合作医疗是针对农村户口而言的，只有农业户口才能加入，而资金一般有补贴、村集体扶持以及个人联合缴费等形式。
社保和农村合作医疗的区别如下：
1、农村合作医疗只是一种医疗保险体系，而社保除了医疗保险之外，还有养老保险、失业保险、伤保险和生育保险；
2、农村合作医疗农业户口才可以参加，而社保没有户口条件的；
3、农村合作医疗必须以家庭为单位整户参加，社保当中的医保也不能单独购买，必须得和其他四险一起购买；
4、农村合作医疗一年一交费，交一年只保一年，若停缴了就享受不到新农合的相关了。而社保完成缴费年限后就可以终身享受；
5、农村合作医疗缴费比例低，报销比例也低，而社保缴费比例高，报销比例也高。
农村合作医疗保险报销流程如下：
1、参加合医人员住院或特定疾病门诊患者在定点医院看病，可以实时联网结算报销，如因其他原因可以回合医办报销的。其医疗费用由其个人垫支，并向医院索取疾病诊断证明，医院收费，费用汇总明细清单，带备医院资料和参加合作医疗资料、身份证或户口簿，银行存折（卡）并填写好合作医疗报销呈批表，由村委会审查并加具意见，逾期不再办理；
2、由街道合医办初审资料；
3、再由合医办把审核资料送市社保局审批理赔。
【法律依据】
《中华人民共和国社会保险法》
第二十三条 职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费
