对于行政处罚部分，申请复议后仍有部分，提起行政诉讼的，应当做到以下几点。
1、确定管辖。当事人可以向行政机关所在地人民起诉，也可以向复议机关所在地人民起诉。二是确定被告比较复杂。
（一）复议案件后，复议机关决定维持原行政行为的，作出原行政行为的行政机关和复议机关为共同被告；
（二）复议机关改变原行政行为的，复议机关为被告。
（三）复议机关未在法定期限内作出复议决定，公民、法人或者其他组织起诉原行政行为的，作出原行政行为的行政机关为被告；
（四）起诉复议机关不作为的，复议机关为被告。
（五）两个以上行政机关作出同一行政行为的，共同作出行政行为的，是共同被告。
（六）行政机关委托的组织所作的行政行为，委托的行政机关是被告。
（七）行政机关被撤销或者变更职权的，继续行使职权的行政机关为被告。到相应的起诉即可。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国行政诉讼法》第十行政案件由最初作出行政行为的行政机关所在地人民管辖。经复议的案件，也可以由复议机关所在地人民管辖。经最高人民批准，高级人民可以根据审判工作的实际情况，确定若干人民跨行政区域管辖行政案件。第二十六条公民、法人或者其他组织直接向人民提起诉讼的，作出行政行为的行政机关是被告。经复议的案件，复议机关决定维持原行政行为的，作出原行政行为的行政机关和复议机关是共同被告；复议机关改变原行政行为的，复议机关是被告。复议机关在法定期限内未作出复议决定，公民、法人或者其他组织起诉原行政行为的，作出原行政行为的行政机关是被告；起诉复议机关不作为的，复议机关是被告。两个以上行政机关作出同一行政行为的，共同作出行政行为的行政机关是共同被告。行政机关委托的组织所作的行政行为，委托的行政机关是被告。行政机关被撤销或者职权变更的，继续行使其职权的行政机关是被告。
