非法集资能两次立案，由于刑事案件的复杂性，同一个案件可以由不同的机关进行立案。立案是指、司法机关及其它行政执法机关对于报案、控告、举报、自首以及自诉人起诉等材料，按照各自的管辖范围进行审查后，决定将其作为刑事案件进行侦查或者审判的一种诉讼活动。
【法律依据】
《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百一十二条
人民、人民或者机关对于报案、控告、举报和自首的材料，应当按照管辖范围，迅速进行审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候，应当立案；认为没有犯罪事实，或者犯罪事实显著轻微，不需要追究刑事责任的时候，不予立案，并且将不立案的原因通知控告人。控告人如果不服，可以申请复议。
