1，和单位协商，由单位为员工补办员工档案。
2，如果无法协商，可以通过向单位所在地提起民事诉讼的方式要求单位赔偿。
3，可以通过诉讼要求单位恢复原状（补办员工档案）、赔偿损失（与档案相关，因档案丢失无法享受各项保险、工资、福利待遇）。
4，相关规定：
（1）《档案法》规定：第七条规定：“机关、团体、企业事业单位和其他组织的档案机构或者档案工作人员，负责保管本单位的档案，并对所属机构的档案工作实行监督和指导。
（2）《企业职工档案管理工作规定》中规定：第九条企业职工档案的内容和分类：
（一）履历材料；
（二）自传材料；
（三）鉴定、考核、考察材料；
（四）评定岗位技能和学历材料（包括学历、学位、学绩、培训结业成绩表和评定技能的考绩、审批等材料）；
（五）政审材料；
（六）参加中国党、共青团及民主党派的材料；
（七）奖励材料；
（八）处分材料；
（九）招用、劳动合同，调动、聘用、复员退伍、转业、工资、保险福利待遇、出国、退休、退职等材料；
（十）其他可供组织参考的材料。
（3）《民法》规定：第一百三十四条承担民事责任的方式主要有：
(一)停止侵害；
(二)排除妨碍；
(三)消除危险；
(四)返还财产；
(五)恢复原状；
(六)修理、重作、更换；
(七)赔偿损失；
(八)支付违约金；
(九)消除影响、恢复名誉；
(十)赔礼道歉。以上承担民事责任的方式，可以单独适用，也可以合并适用。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国档案法》
第二十条涉及国家秘密的档案的管理和利用，密级的变更和解密，应当依照有关保守国家秘密的法律、行规规定办理。
第二十一条鉴定档案保存价值的原则、保管期限的标准以及销毁档案的程序和办法，由国家档案主管部门制定。
禁止篡改、损毁、伪造档案。禁止擅自销毁档案。
第二十二条非国有企业、社会服务机构等单位和个人形成的档案，对国家和社会具有重要保存价值或者应当保密的，档案所有者应当妥善保管。对保管条件不符合要求或者存在其他原因可能导致档案严重损毁和不安全的，省级以上档案主管部门可以给予帮助，或者经协商采取指定档案馆代为保管等确保档案完整和安全的措施；必要时，可以依法收购或者征购。
前款所列档案，档案所有者可以向国家档案馆寄存或者转让。严禁出卖、赠送给外国人或者外国组织。
向国家捐献重要、珍贵档案的，国家档案馆应当按照国家有关规定给予奖励。
第二十三条禁止买卖属于国家所有的档案。
国有企业事业单位资产转让时，转让有关档案的具体办法，由国家档案主管部门制定。
档案复制件的交换、转让，按照国家有关规定办理。
