承包纠纷的处理方式有四种：
1、当事人自行协商解决合同纠纷；
2、第三方机构居中调解；
3、向仲裁委员会申请仲裁；
4、诉讼，通过诉讼解决纠纷也是解决合同纠纷的最终手段。
【法律依据】
《最高人民关于审理涉及农村土地承包纠纷案件适用法律问题的解释》第六条
因发包方违法收回、调整承包地，或者因发包方收回承包方弃耕、撂荒的承包地产生的纠纷，按照下列情形，分别处理：
(一)发包方未将承包地另行发包，承包方请求返还承包地的，应予支持；
(二)发包方已将承包地另行发包给第三人，承包方以发包方和第三人为共同被告，请求确认其所签订的承包合同无效、返还承包地并赔偿损失的，应予支持。但属于承包方弃耕、撂荒情形的，对其赔偿损失的诉讼请求，不予支持。
前款第(二)项所称的第三人，请求受益方补偿其在承包地上的合理投入的，应予支持。
