申请减免个人所得税的流程如下：
1、持税务登记证副本，填写涉税事项综合申请表，提出申请和领取受理回执；
2、备齐所需资料，待主管税务机关收取资料和调查审核；
3、凭受理回执领取批复。可以规定其他减税情形，报全国人民代表大会常务委员会备案。
一、应纳税所得额的计算如下：
1、居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元以及专项扣除、专项附加扣除和依法确定的其他扣除后的余额，为应纳税所得额；
2、非居民个人的工资、薪金所得，以每月收入额减除费用五千元后的余额为应纳税所得额；劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，以每次收入额为应纳税所得额；
3、经营所得，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额；
4、财产租赁所得，每次收入不超过四千元的，减除费用八百元，四千元以上的，减除百分之二十的费用，其余额为应纳税所得额；
5、财产转让所得，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额；
6、利息、股息、红利所得和偶然所得，以每次收入额为应纳税所得额。
二、纳税人应当依法办理纳税申报的情况如下：
1、取得综合所得需要办理汇算清缴；
2、取得应税所得没有扣缴义务人；
3、取得应税所得，扣缴义务人未扣缴税款；
4、取得境外所得；
5、因移居境外注销中国户籍；
6、非居民个人在中国境内从两处以上取得工资、薪金所得；
7、规定的其他情形。
总之，申请减免个人所得税需要符合减免的条件，然后携带税务登记证副本，填写涉税事项综合申请表，备齐所需资料，待主管税务机关收取资料和调查审核，通过后依法享受所规定的的减免。
【法律依据】
《中华人民共和国个人所得税法》
第四条下列各项个人所得，免征个人所得税：
（一）省级、部委和中国人民军以上单位，以及外国组织、国际组织颁发的科学、教育、技术、文化、卫生、体育、环境保护等方面的奖金；
（二）国债和国家发行的金融债券利息；
（三）按照国家统一规定发给的补贴、津贴；
（四）福利费、抚恤金、救济金；
（五）保险赔款；
（六）军人的转业费、复员费、退役金；
（七）按照国家统一规定发给干部、职工的安家费、退职费、基本养老金或者退休费、离休费、离休生活补助费；
（八）依照有关法律规定应予免税的各国驻华使馆、领事馆的外交代表、领事和其他人员的所得；
（九）中国参加的国际公约、签订的协议中规定免税的所得；
（十）规定的其他免税所得。
前款第十项免税规定，由报全国人民代表大会常务委员会备案。
第五条有下列情形之一的，可以减征个人所得税，具体幅度和期限，由省、自治区、直辖市规定，并报同级人民代表大会常务委员会备案：
（一）残疾、孤老人员和烈属的所得；
（二）因自然灾害遭受重大损失的。
可以规定其他减税情形，报全国人民代表大会常务委员会备案。
