法律分析：当土地流转合同一方违反协议时，另一方可以通过起诉或协商等方式来维护自身的权益。具体根据合同条款和相关法律规定来进行维权处理。
法律依据：
1.《中华人民共和国合同法》第五十五条：当事人应当按照合同约定的方式履行义务。未约定或者约定不明确的，应当履行与合同性质、交易习惯和诚信原则相符的义务。
2.《中华人民共和国合同法》第一百三十三条：违反合同的一方应当承担违约责任。
3.《中华人民共和国土地管理法》第三十：农村集体经济组织的土地流转应当遵守法律、法规和，保障农民利益；土地流转所得应当用于发展农村经济和改善农民生活。
维护自身权益的具体措施包括但不限于起诉要求违约方承担相应责任、协商达成赔偿方案等。在维权过程中，需注意合同约定的条款、证据的收集和保全等问题。
