医保入账金额少了的原因如下：
1、医保报销比例不足：不同类型的医保对于不同的医疗项目有不同的报销比例，有些医保可能只能报销部分医疗费用，需要个人自行承担一部分费用；
2、医保报销上限：有些医保可能对于某些医疗项目设定了报销上限，如果医疗费用超过上限，超出部分需要个人自行承担；
3、基础医疗保险基金不足：医保基金是由个人缴纳和资助组成的，如果基金不足，可能会影响个人的医疗报销金额；
4、医保账户余额不足：在个人医保账户内的余额不足以支付医疗费用的情况下，医保报销金额也会受到影响。
医保缴费年限的规定如下：
1、医保缴费是男满25年、女满20年；
2、退休时男性缴费年限累计不满30年，女性缴费年限累计不满25年，用人单位和职工个人按规定一次性补足医疗保险费的，可认定为缴费年限届满；
3、对企业职工来说，医疗保险的视同缴费年限为人事档案记载的实际工作年限。根据我国相关法律规定，职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。
综上所述，如果发现医保入账金额少了，可以到当地社保经办机构进行咨询和查询，了解具体情况并及时处理。
【法律依据】：
《中华人民共和国社会保险法》第十二条
用人单位应当按照国家规定的本单位职工工资总额的比例缴纳基本养老保险费，记入基本养老保险统筹基金。
职工应当按照国家规定的本人工资的比例缴纳基本养老保险费，记入个人账户。
无雇工的个体工商户、未在用人单位参加基本养老保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员参加基本养老保险的，应当按照国家规定缴纳基本养老保险费，分别记入基本养老保险统筹基金和个人账户。
