闯两次红灯扣12分不能代消分。代消分这种行为是违法的，经过工作人员的查实后，不仅会拒绝为车主办理业务，还会对代车主消分的人进行处罚，一般是处2000元的罚款，并且扣12分。车主可以先处理一次闯红灯的违章行为，然后参加学法减分的活动来消除6分，然后再处理另一次闯红灯的违章行为。这样就不用重新参加科目一的学习，也不会影响驾驶证的使用。
用别人的驾驶证扣分会被认定为“买卖分”，将会受到相应的惩罚。首次会被处以罚款：代替实际驾驶人接受机动车交通违法处罚和记分并从中牟取经济利益，暂扣6个月机动车驾驶证并处以罚款。再犯会被处以拘留：代替实际驾驶人接受机动车交通违法处罚和记分并从中牟取经济利益，被处罚后再犯，以及组织、介绍它人代替实际驾驶人接受机动车交通违法处罚和记分并从中牟取经济利益，处十五日以下拘留；吊销机动车驾驶证，五年内不得重新取得机动车驾驶证。违法所得，予以没收。
法律依据：《机动车驾驶证申领和使用规定》第七十一条
机关交通管理部门对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为，除依法给予行政处罚外，实行道路交通安全违法行为累积记分制度，记分周期为12个月，满分为12分。
机动车驾驶人在一个记分周期内记分达到12分的，应当按规定参加学习、考试。
