法律分析：企业应当遵守税收法规，但如若对税务机构认定存在异议，可以提出申诉或者诉讼。在此过程中，应当注意提供证据证明自己的合法性和合规性，同时积极与税务机构进行沟通协商。
法律依据：
1.《中华人民共和国税收征收管理法》第八十六条：纳税人认为税务机关的征收行为违法或者不当的，可以在收到税务机关的书面通知后在六十日内向上一级税务机关申诉，也可以直接向人民提起诉讼。
2.《中华人民共和国行政诉讼法》第二十七条：行政相对人认为行政机关的行政行为侵犯了自己的合法权益的，可以依法提起行政诉讼。
3.《企业所得税法》第五条：依法纳税是企业的法定义务，纳税人应当在法定期限内向税务机关申报和缴纳应纳税款。
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